拟订并组织实施蒙医中医工作的政策措施、管理办法、规章制度、技术标准,组织制定全盟蒙中医药事业发展规划;承担促进传承、保护、应用、开发、发展蒙中医药医学文化有关工作;拟订并组织实施蒙中医药科学研究和技术开发规划;组织开展蒙中医药宣传知识普及、科研成果和适宜技术推广;负责拟订蒙中医药人才发展规划,加快蒙中医药人才队伍建设;监督并规范蒙中医医疗机构和医疗服务秩序等工作;组织开展全盟蒙中医药对外交流与合作等工作。